Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.4 ms