Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms