Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms