Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC8.65□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC8.65□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC8.65□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms