Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms