Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 AC015912.3-201ENST00000619432 348 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 DERL2-206ENST00000572834 589 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC6Q03468 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms