Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BNC1Q01954 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BNC1Q01954 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BNC1Q01954 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BNC1Q01954 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BNC1Q01954 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BNC1Q01954 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BNC1Q01954 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BNC1Q01954 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BNC1Q01954 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BNC1Q01954 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BNC1Q01954 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BNC1Q01954 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BNC1Q01954 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BNC1Q01954 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BNC1Q01954 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BNC1Q01954 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BNC1Q01954 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BNC1Q01954 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BNC1Q01954 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BNC1Q01954 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BNC1Q01954 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
BNC1Q01954 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BNC1Q01954 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BNC1Q01954 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BNC1Q01954 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BNC1Q01954 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
BNC1Q01954 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
BNC1Q01954 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BNC1Q01954 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BNC1Q01954 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
BNC1Q01954 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BNC1Q01954 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
BNC1Q01954 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BNC1Q01954 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BNC1Q01954 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
BNC1Q01954 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BNC1Q01954 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BNC1Q01954 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BNC1Q01954 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BNC1Q01954 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BNC1Q01954 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BNC1Q01954 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BNC1Q01954 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BNC1Q01954 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BNC1Q01954 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BNC1Q01954 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BNC1Q01954 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BNC1Q01954 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BNC1Q01954 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BNC1Q01954 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BNC1Q01954 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BNC1Q01954 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BNC1Q01954 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BNC1Q01954 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BNC1Q01954 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BNC1Q01954 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BNC1Q01954 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BNC1Q01954 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BNC1Q01954 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BNC1Q01954 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BNC1Q01954 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BNC1Q01954 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BNC1Q01954 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BNC1Q01954 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BNC1Q01954 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
BNC1Q01954 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BNC1Q01954 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BNC1Q01954 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
BNC1Q01954 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
BNC1Q01954 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BNC1Q01954 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BNC1Q01954 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BNC1Q01954 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BNC1Q01954 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
BNC1Q01954 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms