Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX1P78337 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX1P78337 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX1P78337 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX1P78337 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX1P78337 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX1P78337 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX1P78337 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX1P78337 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX1P78337 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX1P78337 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX1P78337 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX1P78337 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX1P78337 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX1P78337 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX1P78337 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX1P78337 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX1P78337 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX1P78337 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX1P78337 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX1P78337 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX1P78337 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX1P78337 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX1P78337 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX1P78337 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX1P78337 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX1P78337 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX1P78337 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX1P78337 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX1P78337 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX1P78337 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX1P78337 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX1P78337 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX1P78337 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX1P78337 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX1P78337 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX1P78337 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms