Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 AC092723.2-201ENST00000624955 793 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SUMO1P63165 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms