Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms