Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ACTBP60709 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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