Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CASP9P55211 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CASP9P55211 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CASP9P55211 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CASP9P55211 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CASP9P55211 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CASP9P55211 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CASP9P55211 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CASP9P55211 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CASP9P55211 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CASP9P55211 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CASP9P55211 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CASP9P55211 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CASP9P55211 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CASP9P55211 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CASP9P55211 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CASP9P55211 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CASP9P55211 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CASP9P55211 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CASP9P55211 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CASP9P55211 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CASP9P55211 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CASP9P55211 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CASP9P55211 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CASP9P55211 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CASP9P55211 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CASP9P55211 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CASP9P55211 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CASP9P55211 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CASP9P55211 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASP9P55211 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CASP9P55211 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CASP9P55211 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CASP9P55211 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CASP9P55211 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CASP9P55211 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CASP9P55211 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CASP9P55211 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CASP9P55211 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CASP9P55211 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CASP9P55211 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CASP9P55211 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CASP9P55211 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CASP9P55211 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CASP9P55211 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CASP9P55211 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CASP9P55211 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CASP9P55211 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CASP9P55211 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms