Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DAP3P51398 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DAP3P51398 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DAP3P51398 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DAP3P51398 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DAP3P51398 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DAP3P51398 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DAP3P51398 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DAP3P51398 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
DAP3P51398 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DAP3P51398 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DAP3P51398 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DAP3P51398 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DAP3P51398 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DAP3P51398 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
DAP3P51398 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DAP3P51398 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DAP3P51398 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DAP3P51398 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DAP3P51398 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DAP3P51398 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DAP3P51398 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DAP3P51398 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DAP3P51398 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DAP3P51398 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DAP3P51398 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DAP3P51398 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DAP3P51398 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DAP3P51398 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DAP3P51398 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DAP3P51398 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DAP3P51398 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
DAP3P51398 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DAP3P51398 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
DAP3P51398 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DAP3P51398 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DAP3P51398 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DAP3P51398 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
DAP3P51398 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DAP3P51398 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms