Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms