Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIA2P42262 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms