Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARL1P40616 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARL1P40616 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARL1P40616 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ARL1P40616 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARL1P40616 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARL1P40616 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARL1P40616 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARL1P40616 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ARL1P40616 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ARL1P40616 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARL1P40616 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ARL1P40616 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARL1P40616 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARL1P40616 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ARL1P40616 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARL1P40616 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARL1P40616 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARL1P40616 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ARL1P40616 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARL1P40616 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARL1P40616 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARL1P40616 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARL1P40616 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARL1P40616 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARL1P40616 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ARL1P40616 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARL1P40616 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ARL1P40616 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARL1P40616 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARL1P40616 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARL1P40616 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARL1P40616 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARL1P40616 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ARL1P40616 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ARL1P40616 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ARL1P40616 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARL1P40616 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARL1P40616 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARL1P40616 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARL1P40616 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ARL1P40616 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms