Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms