Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms