Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms