Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms