Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms