Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms