Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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PRKCHP24723 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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PRKCHP24723 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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PRKCHP24723 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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PRKCHP24723 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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PRKCHP24723 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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PRKCHP24723 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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PRKCHP24723 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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