Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.1 ms