Protein–RNA interactions for Protein: P18428

LBP, Lipopolysaccharide-binding protein, humanhuman

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBPP18428 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LBPP18428 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LBPP18428 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LBPP18428 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LBPP18428 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LBPP18428 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LBPP18428 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LBPP18428 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LBPP18428 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LBPP18428 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LBPP18428 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LBPP18428 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LBPP18428 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LBPP18428 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LBPP18428 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LBPP18428 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LBPP18428 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LBPP18428 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LBPP18428 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LBPP18428 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LBPP18428 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LBPP18428 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LBPP18428 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LBPP18428 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LBPP18428 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LBPP18428 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LBPP18428 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LBPP18428 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LBPP18428 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LBPP18428 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LBPP18428 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LBPP18428 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LBPP18428 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LBPP18428 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LBPP18428 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LBPP18428 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LBPP18428 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LBPP18428 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LBPP18428 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LBPP18428 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LBPP18428 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LBPP18428 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LBPP18428 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LBPP18428 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LBPP18428 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LBPP18428 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LBPP18428 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LBPP18428 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LBPP18428 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LBPP18428 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LBPP18428 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LBPP18428 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LBPP18428 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LBPP18428 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LBPP18428 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LBPP18428 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LBPP18428 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LBPP18428 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LBPP18428 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LBPP18428 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LBPP18428 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LBPP18428 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LBPP18428 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LBPP18428 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LBPP18428 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LBPP18428 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LBPP18428 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LBPP18428 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LBPP18428 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LBPP18428 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LBPP18428 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LBPP18428 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LBPP18428 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LBPP18428 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LBPP18428 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LBPP18428 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LBPP18428 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LBPP18428 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LBPP18428 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LBPP18428 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LBPP18428 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LBPP18428 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LBPP18428 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LBPP18428 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LBPP18428 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LBPP18428 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LBPP18428 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LBPP18428 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LBPP18428 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LBPP18428 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LBPP18428 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LBPP18428 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LBPP18428 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LBPP18428 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LBPP18428 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LBPP18428 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LBPP18428 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LBPP18428 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LBPP18428 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LBPP18428 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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