Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms