Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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