Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA4P06727 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA4P06727 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA4P06727 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA4P06727 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA4P06727 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA4P06727 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA4P06727 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA4P06727 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA4P06727 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA4P06727 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA4P06727 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA4P06727 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA4P06727 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA4P06727 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA4P06727 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA4P06727 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA4P06727 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA4P06727 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA4P06727 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA4P06727 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA4P06727 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA4P06727 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA4P06727 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA4P06727 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA4P06727 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA4P06727 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA4P06727 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA4P06727 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA4P06727 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA4P06727 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA4P06727 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA4P06727 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA4P06727 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA4P06727 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA4P06727 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA4P06727 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA4P06727 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA4P06727 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA4P06727 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA4P06727 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA4P06727 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA4P06727 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA4P06727 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA4P06727 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA4P06727 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA4P06727 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA4P06727 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA4P06727 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA4P06727 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA4P06727 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA4P06727 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA4P06727 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA4P06727 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA4P06727 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA4P06727 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA4P06727 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA4P06727 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA4P06727 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA4P06727 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA4P06727 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA4P06727 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA4P06727 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA4P06727 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA4P06727 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA4P06727 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA4P06727 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA4P06727 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA4P06727 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA4P06727 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA4P06727 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA4P06727 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA4P06727 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA4P06727 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA4P06727 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA4P06727 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA4P06727 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA4P06727 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA4P06727 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA4P06727 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA4P06727 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA4P06727 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA4P06727 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA4P06727 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA4P06727 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA4P06727 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA4P06727 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA4P06727 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA4P06727 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA4P06727 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms