Protein–RNA interactions for Protein: O75439

PMPCB, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCBO75439 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMPCBO75439 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 216.8 ms