Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 CADM1-221ENST00000612235 1042 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 HMGA1P2-201ENST00000430198 324 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCC9O60706 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
ABCC9O60706 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCC9O60706 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms