Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP99D6REC4 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms