Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms