Protein–RNA interactions for Protein: A6NMD2

GOLGA8J, Golgin subfamily A member 8J, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8JA6NMD2 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms