Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWF9

TRBV2, T-cell receptor beta variable 2 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV2A0A0J9YWF9 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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TRBV2A0A0J9YWF9 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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TRBV2A0A0J9YWF9 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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TRBV2A0A0J9YWF9 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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TRBV2A0A0J9YWF9 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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TRBV2A0A0J9YWF9 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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TRBV2A0A0J9YWF9 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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TRBV2A0A0J9YWF9 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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TRBV2A0A0J9YWF9 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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TRBV2A0A0J9YWF9 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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TRBV2A0A0J9YWF9 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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