Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PARP3Q9Y6F1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PARP3Q9Y6F1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PARP3Q9Y6F1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PARP3Q9Y6F1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PARP3Q9Y6F1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PARP3Q9Y6F1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PARP3Q9Y6F1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PARP3Q9Y6F1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PARP3Q9Y6F1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PARP3Q9Y6F1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PARP3Q9Y6F1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PARP3Q9Y6F1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PARP3Q9Y6F1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PARP3Q9Y6F1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PARP3Q9Y6F1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PARP3Q9Y6F1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PARP3Q9Y6F1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PARP3Q9Y6F1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PARP3Q9Y6F1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PARP3Q9Y6F1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PARP3Q9Y6F1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PARP3Q9Y6F1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PARP3Q9Y6F1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PARP3Q9Y6F1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PARP3Q9Y6F1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PARP3Q9Y6F1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PARP3Q9Y6F1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PARP3Q9Y6F1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PARP3Q9Y6F1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
PARP3Q9Y6F1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PARP3Q9Y6F1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PARP3Q9Y6F1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PARP3Q9Y6F1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PARP3Q9Y6F1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PARP3Q9Y6F1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PARP3Q9Y6F1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PARP3Q9Y6F1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PARP3Q9Y6F1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PARP3Q9Y6F1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PARP3Q9Y6F1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PARP3Q9Y6F1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PARP3Q9Y6F1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PARP3Q9Y6F1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PARP3Q9Y6F1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PARP3Q9Y6F1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PARP3Q9Y6F1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PARP3Q9Y6F1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PARP3Q9Y6F1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PARP3Q9Y6F1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PARP3Q9Y6F1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PARP3Q9Y6F1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PARP3Q9Y6F1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PARP3Q9Y6F1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PARP3Q9Y6F1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PARP3Q9Y6F1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PARP3Q9Y6F1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PARP3Q9Y6F1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PARP3Q9Y6F1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PARP3Q9Y6F1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PARP3Q9Y6F1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PARP3Q9Y6F1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PARP3Q9Y6F1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PARP3Q9Y6F1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PARP3Q9Y6F1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PARP3Q9Y6F1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PARP3Q9Y6F1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PARP3Q9Y6F1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PARP3Q9Y6F1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PARP3Q9Y6F1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PARP3Q9Y6F1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
PARP3Q9Y6F1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PARP3Q9Y6F1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PARP3Q9Y6F1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PARP3Q9Y6F1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PARP3Q9Y6F1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PARP3Q9Y6F1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PARP3Q9Y6F1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PARP3Q9Y6F1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PARP3Q9Y6F1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PARP3Q9Y6F1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PARP3Q9Y6F1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PARP3Q9Y6F1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PARP3Q9Y6F1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PARP3Q9Y6F1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PARP3Q9Y6F1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PARP3Q9Y6F1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PARP3Q9Y6F1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PARP3Q9Y6F1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PARP3Q9Y6F1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PARP3Q9Y6F1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PARP3Q9Y6F1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PARP3Q9Y6F1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PARP3Q9Y6F1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PARP3Q9Y6F1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PARP3Q9Y6F1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PARP3Q9Y6F1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PARP3Q9Y6F1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PARP3Q9Y6F1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PARP3Q9Y6F1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms