Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W3

KLF2, Krueppel-like factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF2Q9Y5W3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF2Q9Y5W3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF2Q9Y5W3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF2Q9Y5W3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF2Q9Y5W3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF2Q9Y5W3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLF2Q9Y5W3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLF2Q9Y5W3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLF2Q9Y5W3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLF2Q9Y5W3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLF2Q9Y5W3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLF2Q9Y5W3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLF2Q9Y5W3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF2Q9Y5W3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF2Q9Y5W3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF2Q9Y5W3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF2Q9Y5W3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF2Q9Y5W3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF2Q9Y5W3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF2Q9Y5W3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF2Q9Y5W3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF2Q9Y5W3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF2Q9Y5W3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF2Q9Y5W3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF2Q9Y5W3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF2Q9Y5W3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF2Q9Y5W3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF2Q9Y5W3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF2Q9Y5W3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF2Q9Y5W3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF2Q9Y5W3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF2Q9Y5W3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF2Q9Y5W3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF2Q9Y5W3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF2Q9Y5W3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF2Q9Y5W3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF2Q9Y5W3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF2Q9Y5W3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF2Q9Y5W3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms