Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B4

SF3B6, Splicing factor 3B subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B6Q9Y3B4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SF3B6Q9Y3B4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SF3B6Q9Y3B4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms