Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TRAPPC8Q9Y2L5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TRAPPC8Q9Y2L5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TRAPPC8Q9Y2L5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TRAPPC8Q9Y2L5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TRAPPC8Q9Y2L5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
TRAPPC8Q9Y2L5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
TRAPPC8Q9Y2L5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
TRAPPC8Q9Y2L5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
TRAPPC8Q9Y2L5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
TRAPPC8Q9Y2L5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TRAPPC8Q9Y2L5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
TRAPPC8Q9Y2L5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
TRAPPC8Q9Y2L5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
TRAPPC8Q9Y2L5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TRAPPC8Q9Y2L5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
TRAPPC8Q9Y2L5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
TRAPPC8Q9Y2L5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TRAPPC8Q9Y2L5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TRAPPC8Q9Y2L5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
TRAPPC8Q9Y2L5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TRAPPC8Q9Y2L5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
TRAPPC8Q9Y2L5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TRAPPC8Q9Y2L5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TRAPPC8Q9Y2L5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
TRAPPC8Q9Y2L5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TRAPPC8Q9Y2L5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
TRAPPC8Q9Y2L5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
TRAPPC8Q9Y2L5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
TRAPPC8Q9Y2L5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TRAPPC8Q9Y2L5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TRAPPC8Q9Y2L5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TRAPPC8Q9Y2L5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
TRAPPC8Q9Y2L5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
TRAPPC8Q9Y2L5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
TRAPPC8Q9Y2L5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
TRAPPC8Q9Y2L5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
TRAPPC8Q9Y2L5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TRAPPC8Q9Y2L5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TRAPPC8Q9Y2L5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TRAPPC8Q9Y2L5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
TRAPPC8Q9Y2L5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TRAPPC8Q9Y2L5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TRAPPC8Q9Y2L5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
TRAPPC8Q9Y2L5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC34.91■■■■□ 3.18
TRAPPC8Q9Y2L5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
TRAPPC8Q9Y2L5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TRAPPC8Q9Y2L5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TRAPPC8Q9Y2L5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TRAPPC8Q9Y2L5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TRAPPC8Q9Y2L5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
TRAPPC8Q9Y2L5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TRAPPC8Q9Y2L5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
TRAPPC8Q9Y2L5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC34.9■■■■□ 3.18
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TRAPPC8Q9Y2L5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
TRAPPC8Q9Y2L5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TRAPPC8Q9Y2L5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TRAPPC8Q9Y2L5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
TRAPPC8Q9Y2L5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TRAPPC8Q9Y2L5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TRAPPC8Q9Y2L5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TRAPPC8Q9Y2L5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TRAPPC8Q9Y2L5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TRAPPC8Q9Y2L5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
TRAPPC8Q9Y2L5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
TRAPPC8Q9Y2L5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
TRAPPC8Q9Y2L5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
TRAPPC8Q9Y2L5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
TRAPPC8Q9Y2L5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
TRAPPC8Q9Y2L5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
TRAPPC8Q9Y2L5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TRAPPC8Q9Y2L5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TRAPPC8Q9Y2L5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TRAPPC8Q9Y2L5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TRAPPC8Q9Y2L5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TRAPPC8Q9Y2L5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TRAPPC8Q9Y2L5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
TRAPPC8Q9Y2L5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC34.85■■■■□ 3.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
TRAPPC8Q9Y2L5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
TRAPPC8Q9Y2L5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
TRAPPC8Q9Y2L5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TRAPPC8Q9Y2L5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
TRAPPC8Q9Y2L5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TRAPPC8Q9Y2L5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 243 ms