Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SSX2IPQ9Y2D8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSX2IPQ9Y2D8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms