Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFSF13BQ9Y275 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFSF13BQ9Y275 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFSF13BQ9Y275 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFSF13BQ9Y275 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFSF13BQ9Y275 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFSF13BQ9Y275 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFSF13BQ9Y275 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFSF13BQ9Y275 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFSF13BQ9Y275 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFSF13BQ9Y275 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFSF13BQ9Y275 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFSF13BQ9Y275 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFSF13BQ9Y275 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFSF13BQ9Y275 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFSF13BQ9Y275 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFSF13BQ9Y275 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFSF13BQ9Y275 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFSF13BQ9Y275 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFSF13BQ9Y275 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFSF13BQ9Y275 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFSF13BQ9Y275 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFSF13BQ9Y275 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFSF13BQ9Y275 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFSF13BQ9Y275 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFSF13BQ9Y275 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFSF13BQ9Y275 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFSF13BQ9Y275 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFSF13BQ9Y275 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms