Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NUDCQ9Y266 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NUDCQ9Y266 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NUDCQ9Y266 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NUDCQ9Y266 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.57
NUDCQ9Y266 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NUDCQ9Y266 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NUDCQ9Y266 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
NUDCQ9Y266 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NUDCQ9Y266 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NUDCQ9Y266 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NUDCQ9Y266 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NUDCQ9Y266 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NUDCQ9Y266 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NUDCQ9Y266 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NUDCQ9Y266 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NUDCQ9Y266 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NUDCQ9Y266 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NUDCQ9Y266 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NUDCQ9Y266 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NUDCQ9Y266 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NUDCQ9Y266 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NUDCQ9Y266 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NUDCQ9Y266 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NUDCQ9Y266 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NUDCQ9Y266 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NUDCQ9Y266 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NUDCQ9Y266 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NUDCQ9Y266 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NUDCQ9Y266 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NUDCQ9Y266 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NUDCQ9Y266 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NUDCQ9Y266 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NUDCQ9Y266 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NUDCQ9Y266 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NUDCQ9Y266 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NUDCQ9Y266 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NUDCQ9Y266 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NUDCQ9Y266 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NUDCQ9Y266 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NUDCQ9Y266 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NUDCQ9Y266 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NUDCQ9Y266 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NUDCQ9Y266 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NUDCQ9Y266 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NUDCQ9Y266 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NUDCQ9Y266 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NUDCQ9Y266 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
NUDCQ9Y266 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NUDCQ9Y266 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
NUDCQ9Y266 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
NUDCQ9Y266 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
NUDCQ9Y266 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC31■■■□□ 2.55
NUDCQ9Y266 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
NUDCQ9Y266 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NUDCQ9Y266 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NUDCQ9Y266 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NUDCQ9Y266 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NUDCQ9Y266 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NUDCQ9Y266 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NUDCQ9Y266 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
NUDCQ9Y266 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
NUDCQ9Y266 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NUDCQ9Y266 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NUDCQ9Y266 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NUDCQ9Y266 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NUDCQ9Y266 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NUDCQ9Y266 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
NUDCQ9Y266 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NUDCQ9Y266 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NUDCQ9Y266 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NUDCQ9Y266 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NUDCQ9Y266 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NUDCQ9Y266 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
NUDCQ9Y266 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NUDCQ9Y266 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NUDCQ9Y266 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NUDCQ9Y266 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NUDCQ9Y266 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NUDCQ9Y266 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NUDCQ9Y266 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NUDCQ9Y266 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NUDCQ9Y266 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NUDCQ9Y266 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NUDCQ9Y266 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NUDCQ9Y266 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NUDCQ9Y266 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NUDCQ9Y266 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NUDCQ9Y266 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NUDCQ9Y266 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NUDCQ9Y266 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
NUDCQ9Y266 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
NUDCQ9Y266 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
NUDCQ9Y266 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
NUDCQ9Y266 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NUDCQ9Y266 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NUDCQ9Y266 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NUDCQ9Y266 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NUDCQ9Y266 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NUDCQ9Y266 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms