Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GINS2Q9Y248 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GINS2Q9Y248 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GINS2Q9Y248 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GINS2Q9Y248 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GINS2Q9Y248 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GINS2Q9Y248 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GINS2Q9Y248 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GINS2Q9Y248 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GINS2Q9Y248 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GINS2Q9Y248 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GINS2Q9Y248 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GINS2Q9Y248 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GINS2Q9Y248 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GINS2Q9Y248 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GINS2Q9Y248 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GINS2Q9Y248 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GINS2Q9Y248 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GINS2Q9Y248 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GINS2Q9Y248 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GINS2Q9Y248 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GINS2Q9Y248 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GINS2Q9Y248 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GINS2Q9Y248 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GINS2Q9Y248 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GINS2Q9Y248 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GINS2Q9Y248 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GINS2Q9Y248 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GINS2Q9Y248 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GINS2Q9Y248 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GINS2Q9Y248 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GINS2Q9Y248 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GINS2Q9Y248 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GINS2Q9Y248 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GINS2Q9Y248 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GINS2Q9Y248 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GINS2Q9Y248 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GINS2Q9Y248 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GINS2Q9Y248 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GINS2Q9Y248 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GINS2Q9Y248 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GINS2Q9Y248 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GINS2Q9Y248 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GINS2Q9Y248 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GINS2Q9Y248 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GINS2Q9Y248 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GINS2Q9Y248 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GINS2Q9Y248 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GINS2Q9Y248 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms