Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQR0

SCML2, Sex comb on midleg-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML2Q9UQR0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCML2Q9UQR0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCML2Q9UQR0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCML2Q9UQR0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCML2Q9UQR0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCML2Q9UQR0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCML2Q9UQR0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCML2Q9UQR0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCML2Q9UQR0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCML2Q9UQR0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCML2Q9UQR0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCML2Q9UQR0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCML2Q9UQR0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCML2Q9UQR0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCML2Q9UQR0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCML2Q9UQR0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCML2Q9UQR0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCML2Q9UQR0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCML2Q9UQR0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCML2Q9UQR0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCML2Q9UQR0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCML2Q9UQR0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCML2Q9UQR0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCML2Q9UQR0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCML2Q9UQR0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCML2Q9UQR0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCML2Q9UQR0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SCML2Q9UQR0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCML2Q9UQR0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCML2Q9UQR0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCML2Q9UQR0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCML2Q9UQR0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCML2Q9UQR0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCML2Q9UQR0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCML2Q9UQR0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCML2Q9UQR0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SCML2Q9UQR0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SCML2Q9UQR0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCML2Q9UQR0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCML2Q9UQR0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCML2Q9UQR0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SCML2Q9UQR0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCML2Q9UQR0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCML2Q9UQR0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCML2Q9UQR0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCML2Q9UQR0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SCML2Q9UQR0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCML2Q9UQR0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCML2Q9UQR0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCML2Q9UQR0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms