Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQN3

CHMP2B, Charged multivesicular body protein 2b, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2BQ9UQN3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP2BQ9UQN3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms