Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
HDAC5Q9UQL6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HDAC5Q9UQL6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HDAC5Q9UQL6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HDAC5Q9UQL6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HDAC5Q9UQL6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HDAC5Q9UQL6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HDAC5Q9UQL6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HDAC5Q9UQL6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HDAC5Q9UQL6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HDAC5Q9UQL6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HDAC5Q9UQL6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HDAC5Q9UQL6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HDAC5Q9UQL6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HDAC5Q9UQL6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HDAC5Q9UQL6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HDAC5Q9UQL6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HDAC5Q9UQL6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
HDAC5Q9UQL6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HDAC5Q9UQL6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HDAC5Q9UQL6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HDAC5Q9UQL6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HDAC5Q9UQL6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HDAC5Q9UQL6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HDAC5Q9UQL6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HDAC5Q9UQL6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HDAC5Q9UQL6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HDAC5Q9UQL6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HDAC5Q9UQL6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HDAC5Q9UQL6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HDAC5Q9UQL6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HDAC5Q9UQL6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HDAC5Q9UQL6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HDAC5Q9UQL6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HDAC5Q9UQL6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HDAC5Q9UQL6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
HDAC5Q9UQL6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HDAC5Q9UQL6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HDAC5Q9UQL6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HDAC5Q9UQL6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
HDAC5Q9UQL6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HDAC5Q9UQL6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HDAC5Q9UQL6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HDAC5Q9UQL6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HDAC5Q9UQL6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms