Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AGTPBP1Q9UPW5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
AGTPBP1Q9UPW5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
AGTPBP1Q9UPW5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
AGTPBP1Q9UPW5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
AGTPBP1Q9UPW5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AGTPBP1Q9UPW5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AGTPBP1Q9UPW5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
AGTPBP1Q9UPW5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
AGTPBP1Q9UPW5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
AGTPBP1Q9UPW5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AGTPBP1Q9UPW5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AGTPBP1Q9UPW5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
AGTPBP1Q9UPW5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AGTPBP1Q9UPW5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AGTPBP1Q9UPW5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AGTPBP1Q9UPW5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AGTPBP1Q9UPW5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AGTPBP1Q9UPW5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AGTPBP1Q9UPW5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AGTPBP1Q9UPW5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
AGTPBP1Q9UPW5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AGTPBP1Q9UPW5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
AGTPBP1Q9UPW5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AGTPBP1Q9UPW5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AGTPBP1Q9UPW5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AGTPBP1Q9UPW5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AGTPBP1Q9UPW5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AGTPBP1Q9UPW5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AGTPBP1Q9UPW5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AGTPBP1Q9UPW5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AGTPBP1Q9UPW5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AGTPBP1Q9UPW5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AGTPBP1Q9UPW5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AGTPBP1Q9UPW5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AGTPBP1Q9UPW5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AGTPBP1Q9UPW5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AGTPBP1Q9UPW5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AGTPBP1Q9UPW5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AGTPBP1Q9UPW5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
AGTPBP1Q9UPW5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
AGTPBP1Q9UPW5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AGTPBP1Q9UPW5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AGTPBP1Q9UPW5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AGTPBP1Q9UPW5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AGTPBP1Q9UPW5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AGTPBP1Q9UPW5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AGTPBP1Q9UPW5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms