Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN37

VPS4A, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS4AQ9UN37 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS4AQ9UN37 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS4AQ9UN37 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS4AQ9UN37 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS4AQ9UN37 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS4AQ9UN37 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS4AQ9UN37 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS4AQ9UN37 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS4AQ9UN37 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS4AQ9UN37 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS4AQ9UN37 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS4AQ9UN37 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS4AQ9UN37 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS4AQ9UN37 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS4AQ9UN37 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS4AQ9UN37 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS4AQ9UN37 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS4AQ9UN37 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS4AQ9UN37 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS4AQ9UN37 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS4AQ9UN37 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS4AQ9UN37 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS4AQ9UN37 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS4AQ9UN37 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS4AQ9UN37 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS4AQ9UN37 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS4AQ9UN37 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS4AQ9UN37 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS4AQ9UN37 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS4AQ9UN37 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS4AQ9UN37 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS4AQ9UN37 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS4AQ9UN37 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms