Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW3

ABT1, Activator of basal transcription 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABT1Q9ULW3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ABT1Q9ULW3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABT1Q9ULW3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABT1Q9ULW3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ABT1Q9ULW3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABT1Q9ULW3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABT1Q9ULW3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABT1Q9ULW3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABT1Q9ULW3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABT1Q9ULW3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABT1Q9ULW3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABT1Q9ULW3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABT1Q9ULW3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABT1Q9ULW3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABT1Q9ULW3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABT1Q9ULW3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABT1Q9ULW3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABT1Q9ULW3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ABT1Q9ULW3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABT1Q9ULW3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABT1Q9ULW3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABT1Q9ULW3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABT1Q9ULW3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABT1Q9ULW3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABT1Q9ULW3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABT1Q9ULW3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABT1Q9ULW3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABT1Q9ULW3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABT1Q9ULW3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABT1Q9ULW3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABT1Q9ULW3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABT1Q9ULW3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABT1Q9ULW3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ABT1Q9ULW3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ABT1Q9ULW3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABT1Q9ULW3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABT1Q9ULW3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABT1Q9ULW3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABT1Q9ULW3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABT1Q9ULW3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABT1Q9ULW3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ABT1Q9ULW3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABT1Q9ULW3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ABT1Q9ULW3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABT1Q9ULW3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABT1Q9ULW3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABT1Q9ULW3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ABT1Q9ULW3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms