Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CIZ1Q9ULV3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CIZ1Q9ULV3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CIZ1Q9ULV3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CIZ1Q9ULV3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CIZ1Q9ULV3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CIZ1Q9ULV3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CIZ1Q9ULV3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CIZ1Q9ULV3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CIZ1Q9ULV3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CIZ1Q9ULV3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CIZ1Q9ULV3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CIZ1Q9ULV3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CIZ1Q9ULV3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CIZ1Q9ULV3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CIZ1Q9ULV3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CIZ1Q9ULV3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CIZ1Q9ULV3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CIZ1Q9ULV3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CIZ1Q9ULV3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CIZ1Q9ULV3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CIZ1Q9ULV3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CIZ1Q9ULV3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CIZ1Q9ULV3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms