Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNRF3Q9ULT6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNRF3Q9ULT6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNRF3Q9ULT6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNRF3Q9ULT6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNRF3Q9ULT6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNRF3Q9ULT6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZNRF3Q9ULT6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZNRF3Q9ULT6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZNRF3Q9ULT6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZNRF3Q9ULT6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZNRF3Q9ULT6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNRF3Q9ULT6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNRF3Q9ULT6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNRF3Q9ULT6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNRF3Q9ULT6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNRF3Q9ULT6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNRF3Q9ULT6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNRF3Q9ULT6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNRF3Q9ULT6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNRF3Q9ULT6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNRF3Q9ULT6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNRF3Q9ULT6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNRF3Q9ULT6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNRF3Q9ULT6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNRF3Q9ULT6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNRF3Q9ULT6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNRF3Q9ULT6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNRF3Q9ULT6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNRF3Q9ULT6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNRF3Q9ULT6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNRF3Q9ULT6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNRF3Q9ULT6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNRF3Q9ULT6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNRF3Q9ULT6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNRF3Q9ULT6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNRF3Q9ULT6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNRF3Q9ULT6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNRF3Q9ULT6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNRF3Q9ULT6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNRF3Q9ULT6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNRF3Q9ULT6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNRF3Q9ULT6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZNRF3Q9ULT6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZNRF3Q9ULT6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZNRF3Q9ULT6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZNRF3Q9ULT6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZNRF3Q9ULT6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZNRF3Q9ULT6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZNRF3Q9ULT6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms